征东行省的下属机构有：左右司、都镇抚司、理问所、儒学提举司、医学提举司等等，职权与内地有所差别，也有雷同。其中左右司，掌管行省日常事务，置郎中二员，从五品；员外郎二员，从六品；都士二员，从七品。另有下属官吏多名。日常事务之外，还掌管传达朝廷旨意，转交藩国百官上书等。
都镇抚司，是掌管军务的常设机构，长官为正副都镇抚各一员。如果有大的战事，又设行枢密院。
理问所，是掌管法律诉讼的机构，置理问二员，副理问二员。理问所下设有监狱。其职责一是受理行省属官或藩国官员犯罪案件；二是受理藩属国国民投诉的案件。行省执法以元朝法律为准；三是受理藩属国处理不当的案件，有权更改藩属国司法机关的判决。
儒学提举司，是掌管学校、科举之事的机构，统管诸路府州县学校，祭祀教养钱粮事务，考校呈进著述文字，置正副提举各一。
征东行省的儒学提举司并不是具体管理高丽诸路府州县学校、祭祀教养钱粮之事的机构，而是倡导儒学，选拔参加元朝科举人选的机构。
医学提举司，掌管医药和治疗事务，职权主要是考校诸路医生，太医教官，勘校名医撰述文字，辨验药材，训诲太医子弟，设正副提举各一员。
行省官员，除军职之外，文官多有藩属国国王任命，因为是代表天朝，具有特殊的地位，所以经常擅自发号施令，居高临下，欺压当地官民，因此极端遭到当地官吏和百姓痛恨，由此也对天朝产生极度不满。
“听叔叔说来，这可是弊端很严重的，难道朝廷就放任不理？”勃伦赤说完，突然醒悟过来，接着摇头叹气道：“唉，真还指望不上朝廷能有什么大作为，但是殿下却不愿意挑起争端，继承大统。”
“是啊，言归正传，既然已经确定了，老叔我也不再保留，所谓上阵父子兵吗，老叔就为你打一次头阵，剩下的问题可需要你这半个钦差去打扫了！”巴特钮尔突然精神了不少，站起身来，亲自走到门外，吩咐几个亲兵，分头去附近的的几个万户府、千户所、军巡所等送信，命令他们于午后未时赶来镇抚司召开军务会议。之后又找来几个亲信军官，做了一些周到安排。
“你带来的叫什么战队来着？作战能力怎样？”布置完外面事务，巴特钮尔问勃伦赤。
“海军陆战队！是殿下亲自定名，并多次参与指导训练过。现在的训练大纲还是殿下亲自颁发的那。”又略带调皮地说道：“要是三叔不服气，等闲暇时间可以选出你的亲兵，和他们较量一番的！”
军官会议如期召开了，参加会议的高级军官好奇地打量着身着奇怪服饰，但是却很精神的勃伦赤，很长时间心里都不能平静下来，主要是外面的庞大船队给他们的震撼，在镇抚司都镇抚大人的不痛不痒的官面文章中根本没得到平复，直到后面几句话，才转移了注意力。
“给大家介绍一下，这位是赣州路达鲁花赤，上万户府万户勃伦赤大人，同时也是齐王殿下亲自派过来，驰援即将到任的行省达鲁花赤黑牙大人大军的特使。”
就这几句话，让在座的十几员将领顿时一个机灵，面上迅速换了谄媚，或者是异样的面容。勃伦赤却不理会他们的心思，站起身，一个端正的新式敬礼过后，度步来到了巴特钮尔身侧，扫视一眼众军官，徐徐开口说道：“诸位将军辛苦了。作为晚辈，本将非常钦佩各位为了朝廷，为了百姓，长期驻守在边远之地，受尽了各种苦痛和生活不便。但是军人的天职就是服从，绝对的服从。军人的职责就是为朝廷，为国家，为百姓安慰，可以放弃个人一切，哪怕是马革裹尸还。”
“当今朝廷局势，都镇抚大人已经讲过了，本将不再重复，下面要和诸位将军交谈的是：面对如此糜烂局面，我们，做为大元帝国的高级军官该何去何从？”再次扫视众人一眼，勃伦赤点点头说道：“此次帅军来此，本将并非奉朝廷亲令，而是齐王殿下长远大计的组成部分之一。说起来，当年世祖爷亲帅蒙古大军，横扫六合，所向披靡，开疆拓土，真的是马革裹尸还，为我们后代子孙打下了如此辉煌的天地。可悲的是，当今天朝天威不再，当今的天朝军队已经失去了锋芒，竟让一个个行省军事集团，一个个藩属小国给任意欺负，横行不法。每念及此，齐王和我们这些亲近之臣都是心里滴血啊！”
“可喜的是，亲王殿下腾空出世了，他给我们，给整个大元天朝带来了光芒和期望，他的智慧谋略，他的胸襟和远大宏图让我们折服，让所有接触过他，了解他的男女老幼深深感佩。大家看到了吧，海上的这支船队，是我齐王殿下亲自指导建设起来的第五支大洋舰队，其中的最先进的战船，战船上火力威猛的大炮，都是他老，啊亲自设计制作的，有机会请诸位大可登船检视一番！”
“也许你们不太相信，十多岁的齐王殿下无论是学识，远见，还是自身的武功，都达到了让人震撼的地步，称之为神仙都不为过。当年的奸佞之臣，燕铁木儿，几番要谋害于他，结果一是被齐王殿下的才智所震撼，没有舍得下手，而是试图把殿下禁锢在丞相府内，每日里把酒言欢，直到殿下感到憋屈，准备离开，让奸相燕铁木儿把殿下发配荒凉的马岛。出乎朝廷意外，半年多时间，马岛就此彻底改了模样，不论是民心，军心，还是生活设施，军备设施，让试图染指占领马岛的藩属国军队大败而逃。朝廷的奸佞之臣也就此更加忌讳与他，又将殿下遣送更加偏远荒凉的静江府，结果，又是半年多的时间，齐王殿下带领我们飞快发展壮大起来，不仅理直气壮赶走或者处置了一大批贪腐官员，还抵御了多个行省，以及朝廷派来的数十万军队，最后在有绝对取胜把握的情况下，殿下本着避免内斗，节约财政，减少战乱带来的民众之苦的原则，毅然决定和朝廷达成休战协议，撤回了占领了福建、江西、湖广等行省大部土地的军队，专注与辖区各方面发展，同时将主要精力专注到对外开疆拓土上来。”
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